Dr. Eggman (alias Dr. Robotnik) is terug. Hij verandert hulpeloze dieren in robots en dwingt ze om zijn ultieme wapen te bouwen, de Death Egg! Maar deze keer heeft Sonic een vriend die hem kan helpen: Tails! Vind de 7 Chaos Emeralds en stop Dr. Robotniks kwaadaardige plan!